Harran Üniversitesi'nin misyonu, kurumsal değerleri içselleştiren, yaratıcı ve eleştirel düşünceyi teşvik eden, etik ilkelere bağlı, doğa ve çevre bilincine sahip bireyler yetiştirmektir. Ayrıca, yerli ve milli imkânları kullanarak bilgi ve kültür birikimlerini evrensel ölçekte bilim ve teknoloji üretimine dönüştürüp insanlığın hizmetine sunmayı; aynı zamanda bilim, sanat ve kültürün toplumda yaygınlık kazanmasına öncülük etmeyi de misyon edinmiştir.